Winter 1996

Shinichi Kudou, seorang siswa SMA dengan bakat luar biasa dalam pekerjaan detektif, terkenal karena telah memecahkan beberapa kasus yang menantang. Suatu hari, ketika Shinichi melihat dua pria mencurigakan dan memutuskan untuk mengikuti mereka, ia tanpa sengaja menjadi saksi kegiatan ilegal yang mengganggu. Sayangnya, ia tertangkap basah, sehingga para pria itu memberinya dosis obat eksperimental yang diformulasikan oleh organisasi kriminal mereka, meninggalkannya menuju kematiannya. Namun, yang mengejutkan dirinya sendiri, Shinichi hidup untuk melihat hari lain, tetapi sekarang dalam tubuh seorang anak berusia tujuh tahun.

Dengan sempurna mempertahankan kecerdasan aslinya, ia menyembunyikan identitas aslinya dari semua orang, termasuk teman masa kecilnya Ran Mouri dan ayahnya, detektif swasta Kogorou Mouri. Untuk tujuan ini, ia mengambil alias Conan Edogawa, terinspirasi oleh penulis misteri Arthur Conan Doyle dan Ranpo Edogawa.

Shinichi, sebagai Conan, mulai secara diam-diam memecahkan kasus-kasus senior Mouri dari balik layar dengan keterampilan detektifnya yang masih luar biasa, sambil diam-diam menyelidiki organisasi yang bertanggung jawab atas keadaannya saat ini, berharap untuk membalikkan efek obat tersebut suatu hari nanti.

Kaisar Pilaf akhirnya mendapatkan Bola Naga Bintang Hitam setelah bertahun-tahun mencari, yang konon dua kali lebih kuat dari Bola Naga biasa di Bumi. Pilaf hendak mengabulkan permintaannya untuk mendominasi dunia ketika ia diinterupsi oleh Son Gokuu. Akibatnya, Pilaf mengacaukan permintaannya dan secara tidak sengaja mengubah Gokuu kembali menjadi seorang anak.

Setelah permohonan dikabulkan, Bola Naga Bintang Hitam tersebar di seluruh galaksi. Namun, Gokuu menemukan bahwa mereka akan menyebabkan Bumi meledak kecuali mereka semua dikembalikan dalam waktu satu tahun. Bersatu dengan cucunya, Pan, dan Trunks dewasa muda, Gokuu memulai petualangan melalui alam semesta untuk menemukan Bola Naga Bintang Hitam dan menyelamatkan planetnya dari kehancuran.