Tiga puluh tahun yang lalu, benua Eurasia hancur oleh "gempa bumi spasial"—sebuah fenomena yang melibatkan getaran ruang angkasa yang tidak diketahui asalnya—yang mengakibatkan kematian lebih dari 150 juta orang. Sejak itu, gempa bumi ini telah mengganggu dunia secara intermiten, meskipun dalam skala yang lebih ringan.
Shidou Itsuka adalah siswa SMA yang tampaknya rata-rata yang tinggal bersama adik perempuannya, Kotori. Ketika gempa spasial yang akan segera terjadi mengancam keamanan Kota Tengu, dia bergegas untuk menyelamatkannya, hanya untuk terjebak dalam letusan yang dihasilkan. Dia menemukan seorang gadis misterius di sumbernya, yang terungkap sebagai "Spirit," entitas dunia lain yang penampilannya memicu gempa spasial. Segera setelah itu, dia terlibat dalam pertempuran kecil antara gadis itu dan Tim Anti-Roh, pasukan penyerang yang kejam dengan tujuan memusnahkan Roh.
Namun, ada pihak ketiga yang percaya dalam menyelamatkan roh: "Ratatoskr," yang secara mengejutkan diperintahkan oleh adik perempuan Shidou'! Kotori secara paksa merekrut Shidou setelah bentrokan, memberinya metode alternatif untuk menghadapi bahaya yang ditimbulkan oleh Roh—membuat mereka jatuh cinta padanya. Sekarang, nasib dunia bergantung pada kecakapan kencannya, saat dia mencari Roh untuk memikat mereka.
