Cadis Etrama di Raizel, yang juga dikenal sebagai “Rai”, didaftarkan di SMA Ye Ran oleh pelayannya, Frankenstein, untuk bersembunyi dari Union, sebuah organisasi misterius yang mengincar darah Rai. Rai memulai hidupnya sebagai siswa, membiasakan diri dengan teman-teman sekelasnya dan aktivitas sehari-hari manusia. Namun, kehidupan barunya jauh dari damai, dan Rai segera terpaksa menyelamatkan teman-teman barunya dari tangan Union yang telah menculik mereka.
Sementara itu, M-21—seorang agen Union yang menjadi nakal selama operasi penyelamatan Rai—bergabung dengan staf keamanan SMA Ye Ran setelah dilamar oleh kepala sekolah, yang ternyata tak lain adalah Frankenstein sendiri. Di permukaan, M-21 adalah karyawan yang sopan dan santun, tetapi sebenarnya ia terbelenggu oleh ikatan lamanya dengan Union dan konsekuensi tak terelakkan dari pengkhianatannya terhadap organisasi tersebut.
Untuk memperumit masalah, Nobles Regis K. Landegre dan Seira J. Loyard mendaftar di sekolah yang sama untuk menyelidiki Noblesse. Sementara Union melakukan perburuan terhadap M-21 untuk mendapatkan petunjuk mengenai agen mereka yang hilang, Rai terpaksa merahasiakan identitasnya sambil melindungi semua yang ia sayangi.
