Dengan berakhirnya Kejuaraan Interhigh, tim basket Seirin memfokuskan kembali upaya mereka, berlatih lebih keras dari sebelumnya untuk mendapatkan kesempatan berpartisipasi dalam Winter Cup. Tetsuya Kuroko dan Taiga Kagami sama-sama melihat teman-teman lama kembali ke kehidupan mereka, memberikan tantangan baik di dalam maupun di luar lapangan.
Seiring dengan pengembangan keterampilan baru dan terciptanya aliansi baru, musuh dari berbagai tim—raksasa basket SMA seperti Yousen, Shuutoku, dan Touou—menghalangi upaya gigih Seirin untuk mencapai puncak. Semua sekolah ini terbukti menjadi lawan yang tangguh dengan kemampuan yang berkembang secara eksponensial, sementara Kuroko berjuang untuk menemukan keseimbangan antara tekadnya untuk bermain sebagai bagian dari tim dan keinginannya untuk menang.
Dengan luka lama yang kembali terbuka, tantangan baru yang dihadapi di lapangan, dan musuh baru—”Raja-Raja Tanpa Mahkota”—bersumpah untuk mengalahkan harapan baru, akankah Seirin dapat mencapai impian mereka untuk mengalahkan Generasi Keajaiban?
