Tahun 2006, dan lorong-lorong SMA Jujutsu Prefektur Tokyo bergema dengan pertengkaran tiada akhir dan perdebatan sengit antara dua sahabat karib yang tak terpisahkan. Memancarkan kepercayaan diri yang tak tergoyahkan, Satoru Gojou dan Suguru Getou percaya tidak ada tantangan yang terlalu besar bagi penyihir Kelas Khusus muda dan kuat seperti mereka. Mereka ditugaskan untuk mengantarkan dengan selamat seorang gadis yang bijaksana bernama Riko Amanai kepada entitas yang keberadaannya merupakan esensi dari dunia jujutsu. Namun, misi tersebut menjerumuskan mereka ke dalam pusaran konflik moral yang melelahkan yang mengancam untuk menghancurkan persahabatan yang sudah rapuh antara penyihir dan manusia biasa.
Dua belas tahun kemudian, siswa dan penyihir menjadi garis depan pertahanan melawan meningkatnya jumlah kutukan tingkat tinggi yang lahir dari emosi negatif manusia. Seiring pertumbuhan kekuatan entitas tersebut, kesadaran diri dan ambisi mereka juga meningkat. Para kutukan bersatu untuk tujuan bersama yaitu membasmi manusia dan menciptakan dunia yang hanya terdiri dari pengguna energi kutukan, yang dipimpin oleh roh terkutuk kuno yang berbahaya. Untuk menyingkirkan rintangan terbesar mereka—penyihir terkuat, Gojou—mereka mengatur serangan di Stasiun Shibuya pada Halloween. Membagi diri menjadi tim, para penyihir memasuki pertempuran yang siap mempertaruhkan segalanya untuk melindungi orang-orang yang tidak bersalah dan jenis mereka sendiri.
