Haruka Nanase memiliki kecintaan pada air dan semangat untuk berenang. Di sekolah dasar, ia berkompetisi dan memenangkan lomba estafet bersama ketiga temannya, Rin Matsuoka, Nagisa Hazuki, dan Makoto Tachibana. Setelah meraih kemenangan di turnamen, keempat sahabat itu berpisah. Bertahun-tahun kemudian, mereka bertemu kembali sebagai siswa sekolah menengah; namun, Rin sama sekali tidak peduli untuk kembali seperti dulu. Tidak hanya bersekolah di sekolah yang berbeda, satu-satunya hal yang penting baginya adalah membuktikan bahwa ia adalah perenang yang lebih baik dari Haruka.
Setelah pertemuan pahit itu, Haruka, Nagisa, dan Makoto memutuskan untuk membentuk Klub Renang SMA Iwatobi, tetapi mereka membutuhkan anggota keempat jika mereka berharap untuk berpartisipasi dalam turnamen yang akan datang. Masuklah Rei Ryuugazaki, mantan anggota tim atletik yang direkrut oleh Nagisa. Seiring semakin dekatnya waktu untuk berkompetisi, keempatnya mengembangkan ikatan yang erat sambil berlatih dengan intens untuk menjadi yang terbaik dan menyelesaikan masalah antara Haruka dan Rin untuk selamanya.
