Berdasarkan doktrin Teori Kiamat Quirk, kelompok ideologis Humarise yakin bahwa semua manusia dengan quirk adalah orang sakit dan harus dimusnahkan. Untuk membangun kembali dunia, para ekstremis kelompok tersebut telah membuat alat mematikan yang dikenal sebagai “Bom Pemicu” yang menyebabkan orang-orang dengan quirk kehilangan kendali dan mati. Pemimpin mereka, Flect Turn, menghindari penangkapan dari Para Pahlawan Pro yang dikerahkan di seluruh dunia.
Selama studi kerjanya di negara Otheon bersama Pahlawan Pro nomor satu Jepang, Izuku “Deku” Midoriya dituduh melakukan kejahatan yang tidak dia lakukan. Secara tidak sengaja melibatkan Roddy Soul, seorang penduduk setempat, Deku segera mendapati dirinya dalam pelarian bersama bocah itu. Sekarang terserah Rody, Deku, dan teman-teman sekelas Deku untuk menghentikan rencana Bom Pemicu yang digerakkan oleh Flect, sambil menghindari anggota Humarise lainnya yang gigih.
