Setelah melarikan diri dari kematian yang mengancam, Kei Nagai dan rekannya yang baru, Kou Nakano, merencanakan balas dendam terhadap Satou, sesama Ajin mereka yang bertekad mendominasi dunia. Saat Satou memulai serangkaian eksekusi publik, umat manusia bergegas mencari solusi untuk menghentikan penjahat abadi tersebut.
Kei menemukan sekutu yang tidak terduga dalam bentuk dua mantan lawan: pejabat pemerintah tinggi Yuu Tosaki, yang penelitiannya yang luas tentang Ajin memberinya keuntungan taktikal dalam melawan Satou, dan asisten Ajinnya, Izumi Shimomura. Saat faksi Kei terus mengumpulkan sekutu, dia berlomba melawan waktu untuk menghentikan kampanye Satou sebelum membawa kehancuran bagi peradaban seperti yang dia kenal.