Dengan munculnya virus misterius yang membunuh semua orang di atas usia 13 tahun, umat manusia diperbudak oleh vampir haus kekuasaan yang sebelumnya tersembunyi, yang muncul untuk menaklukkan masyarakat dengan janji melindungi para penyintas, dengan imbalan sumbangan darah mereka.
Di antara para penyintas ini adalah Yuuichirou dan Mikaela Hyakuya, dua anak laki-laki yang ditawan dari sebuah panti asuhan, bersama dengan anak-anak lain yang mereka anggap keluarga. Tidak puas diperlakukan seperti hewan ternak di bawah kekuasaan kejam para vampir, Mikaela menyusun rencana pelarian pemberontak yang pada akhirnya ditakdirkan untuk gagal. Satu-satunya yang selamat adalah Yuuichirou, yang ditemukan oleh Moon Demon Company, unit militer yang didedikasikan untuk memusnahkan vampir di Jepang.
Bertahun-tahun kemudian, sekarang menjadi anggota Pasukan Iblis Kekaisaran Jepang, Yuuichirou bertekad untuk membalas dendam pada makhluk yang membantai keluarganya, tetapi dengan harga berapa?
Owari no Seraph adalah anime shounen supernatural pasca-apokaliptik yang mengikuti pencarian balas dendam seorang pemuda, sambil berjuang untuk persahabatan dan kesetiaan melawan rintangan yang tampaknya mustahil.
